Skeniranje na datotečnoj razini određenih mail servera, aplikacija za pohranu sigurnosnih kopija, igara, itd. može povremeno uzrokovati neprirodno ponašanje operativnog sustava. Da biste izuzeli određene aplikacije ili mape od rezidentnog skeniranja, molimo vas slijedite navedene korake:
1. Otvorite glavni prozor programa klikom na ikonu 
u području obavješćivanja na traci zadataka Windowsa ili klikom na Start › All Programs › Eset › ESET Smart Security ili ESET NOD32 Antivirus.
2. Pritisnite tipku F5 za prikaz prozora za napredno podešavanje.
3. U stablu naprednih postavki kliknite na Antivirus i antispyware › Izuzeci i kliknite na gumb Dodaj...
4. Prikazati će vam se prozor Dodavanje izuzetka. Uz pomoć stabla direktorija potražite mapu ili datoteku koju želite izuzeti. Putanja do odabranog direktorija će automatski biti prikazana u polju Izuzeci:. Kliknite U redu da bi ste spremili postavke izuzetka.
NAPOMENA: Da biste izuzeli sadržaj cijelog diska, možete koristiti * simbol kao zamjenski znak. Na primjer, da biste izuzeli kompletni C:\ disk, potrebno je unijeti C:\* u polje Izuzeci:. Da biste od izuzeli sve .doc datoteke, potrebno je unijeti C:\*.doc u polje Izuzeci:. Za dodatne informacije o korištenju zamjenskih znakova u izuzimanju datoteka/mapa, pritisnite tipku F1 iz prozora Dodavanje izuzetka.
5. Klknite U redu i zatvorite glavni prozor programa. Ponovno pokrenite računalo.
Važno! Ako aplikacija koju izuzimate komunicira koristeći mrežne protokole (HTTP, FTP, itd.) također je potrebno slijediti korake u nastavku.
NAPOMENA!Windows Filtering Platform (WFP) je nova komponenta unutar Windows Vista Service Pack 1 i kasnije i Windows Server 2008. WFP arhitektura služi za provjeru mrežne komunikacije, pošto koristi posebne tehnike praćenja, sekcija Web preglednici nije dostupna. Molimo vas slijedite korake u nastavku ako ne koristite Windows Vista Service Pack 1 i kasnije ili Windows Server 2008.
1. U stablu naprednih postavki kliknite na Antivirus i antispyware › Zaštita web pristupa › HTTP › Web preglednici.
2. Ako je aplikacija koju želite izuzeti od skeniranja već navedena na popisu, kliknite u odgovarajući potvrdni okvir dok ne vidite crveni "X". Kliknite U redu da biste spremili promjene,gotovi ste . Ako aplikacija koju želite izuzeti od skeniranja nije na popisu, nastavite na korak 3.
3. Kliknite na gumb Dodaj... i odaberite .exe datoteku željene aplikacije. Aplikacija će se pojaviti na popisu aplikacija za izuzimanje. Kliknite u odgovarajući potvrdni okvir dok ne vidite crveni "X". Kliknite U redu da biste spremili promjene.